《心灵杀手》讲述了一个离奇且充满惊悚的故事，游戏的男主角Alan Wake是一名小有名气的恐怖小说作家，但他写作的全部灵感都来自于他的未婚妻。然而随着Wake的妻子神秘失踪，他不仅写作灵感完全丧失，甚至患上了严重的失眠证。
为了医治失眠，Wake来到了华盛顿洲一个名为Pride Falls的小镇，在那里的睡眠康复诊所治疗失眠。经过治疗，Wake的失眠症被治好了，然而失踪未婚妻的幽灵的出现却彻底改变了他的生活。从此，一个黑暗扭曲的噩梦开始在Wake的现实生活中出现，从恐怖的生物到神秘的蒙面人，各种灵异事件开始在他眼前不断涌现。